耐药菌研究流程与多模态应用系统构建

# 耐药菌研究流程与多模态应用系统构建
## 样本准备与数据采集
- 菌株与抗生素梯度配置
  - 耐药菌/敏感菌培养
    - 样本选择与培养条件
    - 抗生素浓度梯度配置
- 重水标记与动态拉曼检测
  - 微流控CARS实时监测
    - 监测参数设定
    - 数据采集频率优化
- 单细胞拉曼光谱采集
  - 核酸/脂质特征峰提取
    - 特征峰选择标准
    - 数据处理技术比较

## 数据预处理与特征提取
- 拉曼光谱去噪
  - 小波变换与SG滤波
    - 去噪算法选择
    - 参数优化实验
- 代谢活性量化
  - C_D峰强度标准化
    - 标准化方法分析
    - 比较不同标准化方法
- 动态序列处理
  - LSTM时序特征提取
    - 模型参数调整
    - 时序数据形态分析

## 多模态融合模型构建
- 多模态输入层
  - 静态拉曼+动态时序+代谢活性
    - 数据预处理流程整合
    - 特征交互分析
- 跨模态注意力机制
  - 拉曼_代谢特征关联
    - 注意力机制设计
    - 模型效果评估
- 图神经网络构建
  - 细菌_抗生素互作网络
    - 网络设计与优化
    - 模型训练与测试

## 亲和度预测与耐药标识物挖掘
- 亲和度回归预测
  - 抗生素杀菌效率评估
    - 评估模型构建
    - 结果验证与对比
- 耐药分类模型
  - SVM+SHAP可解释分析
    - 模型训练与验证
    - 可解释性分析方法
- 标识物筛选
  - 脂质峰/基因表达关联
    - 筛选标准与流程
    - 关联性分析结果

## 耐药菌结构建模与验证
- 分子动力学模拟
  - 抗生素渗透过程建模
    - 模型构建参数
    - 渗透机制分析
- CRISPR基因敲除验证
  - 表型与光谱特征关联
    - 验证实验设计
    - 结果与分析
- TEM结构观测
  - 细胞壁厚度验证
    - 观察技术与样本处理
    - 数据分析方法

## 输出与应用系统
- 实时预测系统
  - 3小时快速药敏检测
    - 系统架构设计
    - 实时数据处理流程
- 多模态数据库
  - 拉曼标识物图谱库
    - 数据库结构设计
    - 更新与维护策略