大豆百粒重基因发掘与表达分析研究报告

该思维导图展示了大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析。研究通过收集与籽粒大小相关的拟南芥和水稻基因，成功在大豆中找到了175个同源基因，并进行了基因表达谱的分析，识别出21个种子特异性表达基因。同时，筛选出2769个SNP位点，发现与百粒重显著相关的候选基因，并鉴定出4个具有重要功能的基因。这项研究为大豆产量提升提供了重要的基础和方向。

源码

# 大豆百粒重基因发掘与表达分析研究报告
## 基因收集与检索
### 调控籽粒大小/粒重的基因
- 收集59个基因
  - 拟南芥基因
    - 37个基因
    - 包含调控机制
  - 水稻基因
    - 22个基因
    - 相关性分析
### 大豆同源基因检索
- 175个同源基因
  - 分布于
    - 20条染色体
    - 1个Scaffold
  - 同源性分析
## 基因表达谱分析
### 基因表达谱聚类分析
- 171个基因聚类
  - 分为6个亚群
  - A亚群
    - 主要在花中表达
    - 功能分析
### 组织特异性表达
- 21个种子特异性基因
- 11个荚特异性基因
  - 表达模式比较
## SNP位点查找与筛选
### SNP位点查找
- 2769个SNP位点
  - 来源于56份大豆资源
  - 统计分析
### 非同义变异SNP验证
- 16个非同义变异SNP位点
- 5个SNP显著差异
  - 野生与栽培大豆对比
## 候选基因分析
### SNP位点表型分布
- 4个SNP显著差异
  - 野生型百粒重：≥12g
  - 突变型百粒重：<12g
### 候选基因功能注释
- Glyma.05G019800
  - GW7同源基因
- Glyma.07G022800
  - GW6a同源基因
- Glyma.13G259700
  - UBP15/SOD2同源基因
- Glyma.13G261700
  - SOB7同源基因
## 研究结论
### 研究总结
- 鉴定22个种子特异性表达基因
- 筛选4个与百粒重相关的候选基因
### 研究意义
- 基础研究推动
  - 大豆百粒重基因功能研究
- 加速分子调控研究
  - 大豆产量性状提升

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